Škola byla založena 1. března 1927 jako pomocná škola v Opavě, první svého druhu.
O její vznik se zasadil Břetislav Večerek a působil na ní do roku 1938.
Poté byl její rozvoj přerušen předválečnými událostmi. Po osvobození  dochází k jejímu otevření 1. června 1945, kdy do ní chodí 14 dětí. Počty žáků i pedagogů postupně narůstaly.
V roce 1952 je škola spojena s další pomocnou školou, která vznikla v Kateřinkách  v roce 1938 a jejímž zakladatelem byl Rudolf Dluhoš.
Od září 1948 do prosince 2005 má škola označení zvláštní. Ve funkci ředitele se vystřídali Rudolf Dluhoš, Alois Chovanec (1949-1958), Heřma Pravdová (1958-1973), za jejího působení vznikla v polovině září 1962 školní družina. V roce 1973-4 byl ředitelem ustanoven Rudolf Exner, poté Jaroslava Kaštilová (1974-1993).
Od roku 1993 zde působí současná ředitelka Ludmila Mücková.
V roce 1990 dochází ke vzniku druhé zvláštní školy na náměstí
Slezského odboje a pro školu ve Dvořákových sadech tak končí náročné období, kdy se vyučovalo ve třech budovách.
V roce 1995 začíná fungovat i přípravná třída pro děti ze sociokulturně znevýhodněného prostředí. Od 1. ledna 1996 má škola právní subjektivitu a od 1. ledna 2006 je oficiální název školy Základní škola, Opava, Dvořákovy sady 4, příspěvková organizace.